分科課程的突出優點是，注重基礎知識和基本技能的學習，有助於保證中小學的知識質量。根據童年期、少年期和青年初期心理髮展的特點，小學開設的9門學科均係綜合性分科，初中的分科課程系相對綜合的分科．高中的分科課程則屑於相對獨立的分科。需要著重說明的是，把小學原來的思想品德、歷史、地理合併為“社會”，符合小學生思想認識發展的特點，符合優化課程結構的要求，不會削弱思想品德教育。應當看到，把小學班會、隊會和社會實踐活動納入小學課程結構以後，必將大大加強小學的思想品德教育。至於在小學開設外語和電腦，則是新世紀社會發展的必然要求和兒童茁壯成長的必然需要。
分科課程雖有突出的優點，但也存在一些不容忽視的弱點。例如，由於各學科自成體系，各科內容難以吐故納新，相關學科之間也缺乏應有的橫向聯繫。由於知識分割過細，某些學科之向還存在不必要的重複，故佔用了一些不該佔用的教學時間。據此，初中和高中均需開設少量綜合課程，如綜合社會科、綜合理科。在中學開設這類綜合課程，不僅可以彌補某些分科課程的不足，而且可適當降低這類必修分科課程的難度，以擠出一些時間用來開設限定選修學科。當然，這類綜合課程也有許多弱點，它們的弱點往往就是分科課程的優點。顯然，綜合課程與相關的分科課程之間具有相輔相成的關係。因此，初中、高中的綜合課程應與有關分科課程相結合。具體說，如果以綜合社會科和綜合理科分別取代了初中、高中的提高性限定選修學科分別開設的分科形式的物理、化學、生物及歷史、地理，可使這兩類課程都揚長避短，從而使學生得到最佳的發展。上海市教研室、浙江省教委、東北師大附中早已開展了初中綜合課程的實驗，高中綜合課程的實驗也正在廣東和上海少數學校進行。