教育過程的整體結構是指教育過程由哪些局部的、具體的整體來構成．及各個整體之間的關係。
在闡明具體的整體之前，必須首先把握的一個思想方法是系統論的整體性原則。根據系統論的整體性原則，世界上各種對象、事物、過程都不是雜亂無章的偶然堆積，而是一個合乎規律的由各要素組成的有機整體。這一整體的性質和規律、存在於組成其各要素的相互聯繫、相互作用之中。在教育過程理論研究的歷史上，分析方法的歷史功績是把原始籠統的、模糊不分化的教育過程劃分成了德育、智育、體育、美育等若干個具體的教育過程。這種劃分在教育過程理論研究的歷史長河裏是一個必要的階段。但是教育過程不同於物質產品的加工過程。在把模糊不分化的教育過程劃分成各種具體的教育過程以後，想像物質生產過程加工產品那樣，先通過各具體過程對人的各種品質進行分門別類的加工，最後再“組裝”到一個人身上，這是不現實的。教育過程研究不能停留在分析階段，而應沿著人類認識發展的正常邏輯軌道，從分化走向綜合．從認識局部走向認識整體。順應現代科學從高度分析走向高度綜合的歷史趨勢，運用系統科學的整體方法．既看到部分決定整體，又看到整體支配部分；既看到部分是整體的基礎，又看到整體是部分的歸宿，整體由局部組成，又要服從整體。這是整體與局部科學辯證的統一關係。