針對學科課程的優點和缺點，我們一面進行實驗研究，一面分析了本世紀初以來國外中小學課程改革的經驗教訓，從而形成了我們改革中小學課程結構的主張。筆者認為，中小學課程結構的優化應以比較完善的學科課程為主，輔以新型活動課程，兩者有機結合，形成一個整體。這種整體優化的中小學課程結構具有三個層次，即宏觀課程結構、中觀課程結構和微觀課程結構。宏觀課程結構是指課程設置的結構，又叫課程表層結構，它存在於課程計劃之中。新世紀中小學課程的宏觀結構是由三個亞層及多種成分有機組成的整體。其中課程結構存在於分科課程標準(俗稱教學大綱)及活動課程指導綱要內部。中觀課程結構是由各類課程內容之間的橫向組合與縱向組合而形成的有機整體。微觀課程結構又叫深層課程結構，存在於各科教材內部，是各科教材內部各成分、各要素按照一定比例關係組成的有機整體。各科教材的結構支配著各科教材的體系(由特定邏輯順序與學生心理髮展順序有機構成)，各科教材​​的體系則可促進(也可限制)備科教材結構功能的發揮。

中小學課程結構的三個層次具有相互依存、相互制約的關係。宏觀課程結構是中觀課程結構和微觀課程結構賴以形成的支柱；中觀課程結構依附於宏觀課程結構，又是聯結宏觀、微觀課程結構的紐帶；微觀課程結構依附於宏觀、中觀課程結構，又是宏觀、中觀課程結構得以生根的基礎。這三者在一定空間和時間內相互結合，使中小學課程形成了一個由學科課程與活動課程有機構成的立體式的整體結構。